아스코: AI

인간 암 조직의 공간 오믹스 이미지

ASCO의 대규모 임상 시험 자료 중에서 암세포와 환경의 상호 작용을 "거의 단일 세포 해상도"로 매핑하려는 야심찬 목표를 가진 새로운 연구 프로젝트가 공식적으로 데뷔했습니다.

MOSAIC(Multi Omic Spatial Atlas in Cancer)라고 불리는 이 프로젝트에는 일련의 학술 암 연구 기관과 환자 샘플에서 새로운 바이오마커와 치료 목표를 찾는 데 사용되는 기계 학습 모델을 전문으로 하는 인공 지능 회사 Owkin이 함께 참여합니다. 공간 생물학 회사 NanoString.

MOSAIC은 Owkin의 5천만 달러 자금 지원으로 시작하고 있으며 유전자 서열 분석과 이미징 기술을 결합하여 RNA와 단백질의 존재나 양뿐만 아니라 물리적 위치도 분석하는 '공간 오믹스(spatial omics)'라는 기술을 사용할 예정입니다. 세포와 그들이 거주하는 미세 환경에 위치합니다.

피츠버그 대학, Gustave Roussy, 로잔 대학 병원, Uniklinikum Erlangen/Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg 및 Charité-Universitätsmedizin Berlin을 하나로 묶은 컨소시엄에 따르면, 연구 프로젝트는 기존 공간 오믹스보다 100배 더 큽니다. 데이터세트. 앞으로 몇 달 안에 더 많은 조직이 이러한 노력에 동참할 것으로 예상됩니다.

파트너에 따르면, 여러 암에 걸쳐 약 7,000명의 환자로부터 데이터가 생성될 것이며 연구자들이 분자 수준에서 암을 더 잘 이해하고 다양한 형태의 암을 더 정확하게 특성화하며 궁극적으로 새롭고 개선된 치료법으로 이어질 수 있는 새로운 표적을 식별하는 데 도움이 될 것입니다. . 현재 프로젝트에는 일반적으로 50명 미만의 환자가 참여합니다.

Owkin의 CEO인 Thomas Clozel은 LinkedIn 게시물에서 "AI와 결합된 공간 오믹스가 암 연구의 차세대 혁명을 주도하는 촉매제라고 믿습니다."라고 말했습니다. "유전자를 조직에, 종양을 미세환경에 결합하면 세포주 연구가 놓칠 수 있는 환자 데이터를 발견할 수 있습니다."

초기 컨소시엄의 주요 목표는 이 분야에서 활동하는 연구 그룹을 위한 공통 플레이북을 만들기 위해 공간 오믹스 데이터를 분석하고 비교하는 방법을 관리하는 표준을 개발하는 것입니다. 머지않아 표준화된 데이터와 데이터 생성 및 분석 방법이 전 세계 생물의학 커뮤니티에 공개되어 이 분야의 연구를 가속화할 수 있기를 바랍니다.

모자이크는 초기에 비소세포폐암, 삼중음성유방암, 미만성 거대 B세포 림프종, 난소암, 교모세포종, 중피종, 방광암 등 의학적 수요가 충족되지 않은 암에 초점을 맞출 것이라고 파트너들은 밝혔다.